Der Stoffwechsel wird vorwiegend von der Biochemie erforscht ist aber in der Medizin und Physiologie von grosser Bedeutung. Er ist die Grundlage aller lebenswichtigen Vorgänge im Körper. Dies beinhaltet alle chemischen und physikalischen Vorgänge. Die Bestandteile der zugeführten Nährstoffe werden in den Zellen verstoffwechselt, - also aufgebaut, abgebaut und zu neuen Substanzen umgebaut. Es ist ein komplexes Netzwerk einzelner von einander abhängigen Reaktionen. Das wichtigeste Ausscheidungsorgan dieser Vorgänge ist die Leber. Sie filtert alle schädlichen Stoffe. Ebenso sind Hormone und Enzyme sehr wichtig. Der ganze Stoffwechselprozess wird wesentlich durch das Hormon- und Nervensystem gesteuert, aber auch Umweltfaktoren beeinflussen ihn massgebend. Damit er seine Aufgaben erfüllen kann braucht er Energie. Diese wird von den Kraftwerken der Zellen produziert .Wie der Stoffwechsel selbst brauchen auch diese Mitochondrien (Kraftwerke) Nährstoffe um diese Energie zu Verfügung stellen zu können. Voraussetzung für die Aufnahme dieser Nährstoffe ist ein intakter Darm, das heisst eine gesunde Darmflora. Wir unterscheiden einen Kohlenhydrat-, Eiweiss-, Fett- und Mineralstoffwechsel.